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scopry/primers_biomol

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primers_biomol

Este código aun no está terminado Me falta aplicarlo a secuencias y el método no_hairpin aun no esta terminado porque es un poco ambiguo

Para la selección de primers al momento de amplificar una secuencia deseada, se deben seguir ciertos criterios:

  • Largo mínimo 17 bp
  • No se deben formar primer-dimers; No más de 2 nucleótidos complementados en los últimos 4 nucleótidos del 3' end de los dos primers (forward y reverse)
  • Al menos 50% GC content en ambos primers
  • Extremo 3' G o C en cada primer para estabilidad
  • T anneling 50-65 °C en ambos primers
  • Diferencia máxima entre los primers de 5°C
  • Ambos nucleotidos no deben formar hairpin; no mas de 2 nucleótidos haciendo hairpin (no entiendo muy bien esto)

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